मुख्य लेखा नियंत्रक के अंतर्गत बजट प्रभाग वित्त मंत्रालय के साथ समन्वय में वार्षिक बजट की तैयारी में शामिल है। वर्ष के दौरान बजट प्रक्रिया में मंत्रालय की मांगों से संबंधित विस्तृत अनुदानों मांगों (डी डी जी ) की तैयारी, बजट अनुमानों का विवरण तैयार करना, मध्यम अवधि व्यय फ्रेमवर्क का संकलन, सभी पुन: विनियोजन प्रस्ताव, वित्त मंत्रालय के समन्वय से पूरक प्रस्ताव, संसदीय स्थायी समिति के संबंध में कार्रवाई रिपोर्ट का संकलन, और संसद के दोनों सदनों में माननीय मंत्री द्वारा अर्धवार्षिक वक्तव्य देने की कार्रवाई शामिल हैं । बजट प्रभाग द्वारा सभी प्रभागों के परामर्श से आउटपुट आउटकम की रूपरेखा भी संकलित की जाती  है और वित्त मंत्रालय के बजट दस्तावेजों में शामिल करने के लिए नीति आयोग को भेजी जाती है।